Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GCC1Q96CN9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCC1Q96CN9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCC1Q96CN9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms