Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VOPP1Q96AW1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VOPP1Q96AW1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms