Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLUAP1Q96AJ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLUAP1Q96AJ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms