Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCE1Q969G3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.5 ms