Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFRSF25Q93038 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF25Q93038 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms