Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PRG4Q92954 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PRG4Q92954 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PRG4Q92954 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms