Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRN2Q92932 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms