Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERCC4Q92889 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC4Q92889 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms