Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FRAT1Q92837 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FRAT1Q92837 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms