Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RABGGTAQ92696 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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RABGGTAQ92696 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RABGGTAQ92696 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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