Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX38Q92620 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX38Q92620 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX38Q92620 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX38Q92620 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DHX38Q92620 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DHX38Q92620 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DHX38Q92620 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms