Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CTTNBP2Q8WZ74 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
CTTNBP2Q8WZ74 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms