Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALLDQ8WX93 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PALLDQ8WX93 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PALLDQ8WX93 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms