Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCN9Q8WX39 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCN9Q8WX39 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms