Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF31Q8WWY3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF31Q8WWY3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms