Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAPPC12Q8WVT3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC12Q8WVT3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms