Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1Q8WV22 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE1Q8WV22 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms