Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

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Length 740 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN4Q8WUT4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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