Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD1Q8NHV4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD1Q8NHV4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms