Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AVL9Q8NBF6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms