Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIML1Q8N9V2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIML1Q8N9V2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIML1Q8N9V2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIML1Q8N9V2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIML1Q8N9V2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIML1Q8N9V2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIML1Q8N9V2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms