Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC155Q8N6L0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC155Q8N6L0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms