Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPM1KQ8N3J5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPM1KQ8N3J5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms