Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVBPQ8N300 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms