Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRRC47Q8N1G4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRC47Q8N1G4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRC47Q8N1G4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms