Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00518Q8N0U6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00518Q8N0U6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms