Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLFN12Q8IYM2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLFN12Q8IYM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms