Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT20Q8IY31 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT20Q8IY31 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFT20Q8IY31 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms