Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB4Q86W47 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNMB4Q86W47 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms