Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PBRM1Q86U86 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
PBRM1Q86U86 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PBRM1Q86U86 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms