Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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