Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NANOGNBQ7Z5D8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NANOGNBQ7Z5D8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms