Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q71RC1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q71RC1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q71RC1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q71RC1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q71RC1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q71RC1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q71RC1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q71RC1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q71RC1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q71RC1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q71RC1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q71RC1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q71RC1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms