Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IKBIPQ70UQ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IKBIPQ70UQ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IKBIPQ70UQ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IKBIPQ70UQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IKBIPQ70UQ0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IKBIPQ70UQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms