Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PAXIP1Q6ZW49 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAXIP1Q6ZW49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAXIP1Q6ZW49 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms