Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRCAPQ6ZRS2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SRCAPQ6ZRS2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRCAPQ6ZRS2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms