Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM72Q6ZMU5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms