Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TREML4Q6UXN2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TREML4Q6UXN2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms