Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRSAM1Q6UWE0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRSAM1Q6UWE0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRSAM1Q6UWE0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms