Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATRAIDQ6UW56 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATRAIDQ6UW56 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms