Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OPN5Q6U736 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OPN5Q6U736 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms