Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SAMD1Q6SPF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SAMD1Q6SPF0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms