Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM4Q6P4Q7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNNM4Q6P4Q7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNNM4Q6P4Q7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNNM4Q6P4Q7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms