Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R18Q6NYC8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R18Q6NYC8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms