Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGMBQ6NW40 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RGMBQ6NW40 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RGMBQ6NW40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms