Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEPROQ6NW34 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEPROQ6NW34 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms