Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC70Q6NSX1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC70Q6NSX1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms