Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT80Q6KB66 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT80Q6KB66 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT80Q6KB66 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRT80Q6KB66 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRT80Q6KB66 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms