Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INTS3Q68E01 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
INTS3Q68E01 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms