Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CARMIL1Q5VZK9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CARMIL1Q5VZK9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CARMIL1Q5VZK9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL1Q5VZK9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms